学院先后承担了“973”、“863”课题，国家自然科学基金项目，科技部、教育部、交通部、国土资源部、中国地质调查局、建设部以及省级和地方等重大研究课题百余项，年均科研经费3200万元左右。学院科研成果辉煌，先后获得包括国家科技进步一等奖在内的国家级、省部级科技奖励50余项，出版学术专著60余部。近五年，学院共获批国家自然科学基金重点项目2项，面上、青年与国际合作项目36项，国家支撑与水重大专项2项，以及其他省部级等纵向课题总计265项，累计纵横项目到款金额比例为52.4%，获国家科技进步二等奖1项、省部级科技进步一、二等奖3项；论文被SCI、EI及ISTP收录近400篇，其中SCI共收录230篇；申请发明专利25项。截止2017年2月，学院共有4篇SCI收录论文为高被引论文，且其中三篇为热点文章。

学院1982年开始招收硕士研究生，1984年开始招收博士研究生。李佩成院士指导的冯国璋博士论文“人事活动对区域水文生态系统的影响”获得全国百篇优秀博士论文，王文科教授指导的孔金玲博士论文“水文地质空间信息系统”获陕西省优秀博士论文和全国百篇优秀博士论文提名奖。几十年来为国家培养了数以万计的本科生、研究生和博士生，其中许多人已经成为本部门的领导或专家、教授。现有全日制本科学生1700余人，硕士研究生390余人、博士研究生80余人。

学院十分重视学术交流，先后与德国、美国、加拿大、英国、南非、日本、韩国、瑞士、哈萨斯克坦、俄罗斯等国家以及香港、台湾地区同行进行科研合作与交流。成功举办了“2016城镇地质环境与可持续发展论坛” 、“干旱半干旱地区水资源与污染控制国际研讨会”、“水资源与环境保护国际研讨会(ISWREP 2011)”、“海峡两岸地下水与水文地质应用研讨会”、“2009、2015地下水论坛”等会议，作为支持单位参与了第34届国际水文地质大会的举办；先后邀请了包括两院院士在内的多名国内外知名专家、学者来院开展学术交流；同时，学院与德国土宾根大学合作，创建了“国际干旱半干旱地区水资源与环境研究培训中心”。

多年来，学院坚持产、学、研结合，与交通部、国土资源部、建设部、国家环保总局、水利部等部门的几十家科研院所和企业保持着良好的科研合作关系。依靠人才及设备优势，积极开展对外技术咨询与服务，取得了显著的社会和经济效益。近年来，学院先后为生产和科研单位举办各类专业研究生学位课程进修班、工程硕士班、成人学历班、短训班50余期，培训各类人才5000余人。